299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_R0041 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-1  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0953883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0036  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000218585  hitchhiker  0.0000000000151476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0024  tRNA-Met  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0007  tRNA-Met  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0037  tRNA-Met  97.67 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000950191  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0001  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0049  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0021032  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0005  tRNA-Met  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0012  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000647679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0013  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000171351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0073  tRNA-Met  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0009  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.374214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  94.44 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  94.44 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.44 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0044  tRNA-Met  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0027  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.800046  normal  0.352894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0034  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  85.96 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  85.96 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0026  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>