34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0570 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  70.97 
 
 
128 aa  197  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  68.55 
 
 
125 aa  183  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  68 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  64.8 
 
 
125 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1217  hypothetical protein  61.6 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  52.42 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  53.23 
 
 
125 aa  143  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2895  hypothetical protein  72.41 
 
 
223 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  27.62 
 
 
195 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  32 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  31.37 
 
 
187 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  31.37 
 
 
187 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  28.04 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  29.81 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  30.39 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  30.39 
 
 
187 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  34.52 
 
 
189 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  30.39 
 
 
187 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  31.91 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  26.21 
 
 
188 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  30.85 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  30 
 
 
188 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  27 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  29.41 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  25.96 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  26.32 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  22.33 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  24.49 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  26.32 
 
 
190 aa  41.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  24.74 
 
 
191 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>