21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1217 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  254  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  66.67 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  65.32 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  61.6 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  58.06 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  56.45 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2895  hypothetical protein  59.3 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  28.3 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  30.14 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  25 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  35.21 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  30.3 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  27.84 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  26.42 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  27.72 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  25.96 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  22.33 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  29.25 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  29.25 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>