29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1752 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  92.8 
 
 		 125 aa  233  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  58.06 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  57.26 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  53.23 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1217  hypothetical protein  56.45 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  55.65 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2895  hypothetical protein  63.22 
 
 		 223 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  31.58 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  27.36 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  26.92 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  27.18 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  29.29 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  28.57 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  29.29 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  29.29 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  29.29 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  33.33 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  27.08 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  30.21 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  28.43 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  28.28 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  26.67 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  32.35 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  27.27 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  27.27 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  27.27 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  27.27 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>