32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2838 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  70.97 
 
 		 131 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  68.8 
 
 		 125 aa  184  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  66.94 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  62.9 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2895  hypothetical protein  82.42 
 
 		 223 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1217  hypothetical protein  58.06 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  54.84 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  29.81 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  27.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  31.31 
 
 		 192 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  31.4 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  24.53 
 
 		 188 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  28.42 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  31.25 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  28.42 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  28.72 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  29 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  28.57 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  26.21 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  27.88 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  26.53 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  25 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  27.27 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  25.51 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  25.51 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  25.51 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  23.71 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>