More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2606 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2606  Inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
164 aa  331  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0367  inorganic pyrophosphatase  44.94 
 
 
211 aa  159  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0519972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0349  inorganic diphosphatase  45.81 
 
 
211 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.194571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_311  inorganic pyrophosphatase  45.16 
 
 
211 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1790  Inorganic diphosphatase  48.72 
 
 
169 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.943099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1478  inorganic diphosphatase  43.51 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4284  Inorganic diphosphatase  44.52 
 
 
190 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  0.0985674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4510  Inorganic diphosphatase  46.21 
 
 
168 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05935  inorganic pyrophosphatase  44 
 
 
175 aa  140  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3452  Inorganic diphosphatase  47.18 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1175  inorganic diphosphatase  41.77 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1583  Inorganic diphosphatase  41.56 
 
 
168 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4310  inorganic diphosphatase  44.1 
 
 
179 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.584318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9180  Inorganic diphosphatase  45.7 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0526  Inorganic diphosphatase  41.46 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155032  normal  0.0183134 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4965  Inorganic diphosphatase  47.97 
 
 
175 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0307  Inorganic diphosphatase  47.37 
 
 
167 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0302  inorganic diphosphatase  43.4 
 
 
180 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.335461  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1491  Inorganic diphosphatase  42.95 
 
 
169 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.113986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6230  Inorganic diphosphatase  45.16 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1645  Inorganic diphosphatase  44.76 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2902  inorganic diphosphatase  43.67 
 
 
171 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1712  inorganic diphosphatase  44.9 
 
 
178 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000278082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24820  inorganic pyrophosphatase  44.72 
 
 
200 aa  134  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3268  Inorganic diphosphatase  41.03 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4313  inorganic diphosphatase  47.22 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0520485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3712  inorganic pyrophosphatase  37.89 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4751  inorganic diphosphatase  47.22 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0199  inorganic diphosphatase  44.37 
 
 
161 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.149431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1481  inorganic pyrophosphatase  37.89 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8433  Inorganic diphosphatase  42.07 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0843  Inorganic diphosphatase  46.53 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0611  Inorganic diphosphatase  45.71 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1383  inorganic diphosphatase  46.21 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222018  normal  0.145015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5165  inorganic diphosphatase  42.07 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451945  normal  0.191198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4779  inorganic diphosphatase  42.07 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0696  Inorganic diphosphatase  41.77 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0438  inorganic diphosphatase  42.76 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4865  inorganic diphosphatase  42.07 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13659  inorganic pyrophosphatase  47.33 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2196  Inorganic diphosphatase  40 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00250727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0622  Inorganic diphosphatase  42.58 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.822805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32140  inorganic pyrophosphatase  45.86 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0281065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0433  Inorganic diphosphatase  40 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1030  Inorganic diphosphatase  42.77 
 
 
183 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12760  inorganic pyrophosphatase  44.83 
 
 
170 aa  127  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2109  Inorganic diphosphatase  43.45 
 
 
170 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.013609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2997  Inorganic diphosphatase  42.42 
 
 
164 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2698  Inorganic diphosphatase  43.75 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2068  Inorganic diphosphatase  43.94 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35740  inorganic pyrophosphatase  41.45 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2042  Inorganic diphosphatase  43.94 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05121  inorganic pyrophosphatase  42.22 
 
 
175 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4023  Inorganic diphosphatase  40.65 
 
 
170 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05751  inorganic pyrophosphatase  42.96 
 
 
182 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05691  inorganic pyrophosphatase  42.22 
 
 
175 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1844  inorganic pyrophosphatase  42.22 
 
 
175 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.549684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1840  inorganic diphosphatase  42.86 
 
 
171 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.486698  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05381  inorganic pyrophosphatase  42.22 
 
 
184 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05681  inorganic pyrophosphatase  42.22 
 
 
184 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0695  inorganic diphosphatase  41.48 
 
 
169 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07471  inorganic pyrophosphatase  43.41 
 
 
174 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3708  inorganic diphosphatase  45.45 
 
 
184 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000673823  hitchhiker  0.00000115915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1519  inorganic diphosphatase  43.18 
 
 
170 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  36.88 
 
 
172 aa  120  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0512  inorganic pyrophosphatase  41.48 
 
 
184 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3220  inorganic diphosphatase  45.38 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3548  inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1663  inorganic diphosphatase  40.6 
 
 
169 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2579  Inorganic diphosphatase  41.18 
 
 
206 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2675  Inorganic diphosphatase  41.18 
 
 
206 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1282  inorganic diphosphatase  41.18 
 
 
206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  38.65 
 
 
172 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0187  inorganic diphosphatase  42.86 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1191  Inorganic pyrophosphatase  42.86 
 
 
164 aa  117  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  39.24 
 
 
179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2485  inorganic diphosphatase  40.4 
 
 
215 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0123323  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1408  inorganic diphosphatase  41.38 
 
 
161 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  39.24 
 
 
174 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  37.97 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5381  inorganic diphosphatase  41.38 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.195722  hitchhiker  0.00363944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3667  Inorganic diphosphatase  37.82 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.75284  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  36.48 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0304  Inorganic pyrophosphatase  35.06 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.21579 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3063  Inorganic diphosphatase  36.24 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0015  inorganic diphosphatase  40.26 
 
 
185 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2590  Inorganic diphosphatase  34.19 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0146  inorganic diphosphatase  44.53 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0552  Inorganic diphosphatase  43.51 
 
 
166 aa  111  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01180  inorganic pyrophosphatase  44.52 
 
 
195 aa  111  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  39.63 
 
 
178 aa  111  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0306  Inorganic diphosphatase  44.53 
 
 
162 aa  111  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0312  Inorganic diphosphatase  36.24 
 
 
177 aa  110  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  36.08 
 
 
171 aa  110  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0258  Inorganic diphosphatase  40.94 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  38.64 
 
 
172 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  35.85 
 
 
176 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0470  inorganic diphosphatase  35.62 
 
 
212 aa  108  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0790393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3968  inorganic diphosphatase  34.62 
 
 
184 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1978  inorganic diphosphatase  36.2 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>