24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0707 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0707  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 335 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  28.29 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  26.11 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  25.27 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  25.13 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  26.52 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.88 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  25.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.74 
 
 		 295 aa  46.2  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23.88 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  26.36 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  31.03 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  31.93 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  28.57 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  24.19 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.92 
 
 		 313 aa  42.7  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>