88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1329 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  100 
 
 
276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  80 
 
 
275 aa  474  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  46.64 
 
 
272 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  41.89 
 
 
273 aa  225  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  40.52 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.56 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
282 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
307 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  29.69 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.31 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
278 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.56 
 
 
337 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  28.52 
 
 
338 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  28.52 
 
 
338 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.52 
 
 
338 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  26.21 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  25.81 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.59 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.59 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.4 
 
 
338 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.19 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.19 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  29.64 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  26.25 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.73 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.12 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  27.72 
 
 
328 aa  79  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  26.84 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.79 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  25.4 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.79 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  26.91 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.4 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.4 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  29.25 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  22.8 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  26.79 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  29.25 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  29.25 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  25.5 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  29.25 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  25.19 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  25.38 
 
 
242 aa  72  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  24.6 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  26.51 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  26.51 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  26.51 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  26.51 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  26.51 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  24.73 
 
 
1014 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
401 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  24.72 
 
 
347 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  24.4 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  24.64 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  26.1 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  24.81 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  26.1 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  25.2 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  27.61 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  23.44 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  26.15 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  26.13 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  25.1 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.39 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 
630 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.31 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  24.08 
 
 
401 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  27.33 
 
 
610 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.73 
 
 
316 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  26.48 
 
 
358 aa  55.5  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
381 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 
401 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  28.19 
 
 
602 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  22.31 
 
 
167 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2334  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 
413 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
398 aa  48.9  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  23.1 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  25 
 
 
615 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  21.96 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>