86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0083 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  99.09 
 
 		 331 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  99.09 
 
 		 331 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  100 
 
 		 331 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  98.79 
 
 		 331 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  98.49 
 
 		 331 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  98.77 
 
 		 163 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  99.4 
 
 		 167 aa  335  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  47.9 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  47.57 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  46.71 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  46.71 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  46.71 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  50.32 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  43.41 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  42.72 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  43.09 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  43.09 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  43.09 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  43.09 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  43.09 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  43.09 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  42.72 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  36.39 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.36 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.05 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.05 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  37.74 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.44 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  37.74 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  38.19 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  38.19 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  38.19 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.19 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  37.86 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  37.54 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  37.54 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  31.93 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.19 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  30.29 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  29.93 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  24.63 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  26.32 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  25.4 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  26.57 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  26.85 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  26.54 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  23.62 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  27.8 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  23.43 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  26.87 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.72 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  24.58 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  29.5 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  24.83 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  20.44 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  23.04 
 
 		 697 aa  57  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  25.49 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  25.35 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  20.83 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  25.5 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  27.57 
 
 		 610 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  29.65 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  24.25 
 
 		 1014 aa  51.2  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  22.87 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  24.73 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  20.22 
 
 		 259 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  27.43 
 
 		 615 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.18 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0711  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 497 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  25.71 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>