84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2963 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 319 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  56.65 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  56.33 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  43.77 
 
 		 342 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  29.31 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.33 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.18 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.18 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.18 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.18 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.18 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  31.14 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  33.94 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  28.51 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  27.08 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.54 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  30.54 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  30.54 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  30.54 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  25.52 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  25.1 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  29.89 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  30.08 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  29.34 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  29.34 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  24.22 
 
 		 697 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  25.53 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  26.33 
 
 		 1014 aa  69.3  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  25.69 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.74 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  26.38 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  28.19 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  32.17 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  27 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  21.25 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.88 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  28.02 
 
 		 602 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  30.95 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.84 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3410  glycosyl transferase family 8  26.21 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  25.5 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  27.12 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  27.12 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  27.12 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  30.59 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  27.12 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  27.12 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.96 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.96 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  25.98 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  27.57 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  26.63 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.95 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  26.32 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3139  glycosyl transferase family 8  29.67 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.03 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  26.55 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.03 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.55 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  26.55 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  21.46 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  23.74 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  28.74 
 
 		 610 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  26.06 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  22.92 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 282 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  21.35 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 398 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.22 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.22 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.22 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.22 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  25.17 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  25.86 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>