89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3964 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  95.86 
 
 		 338 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  95.27 
 
 		 338 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  100 
 
 		 338 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  94.38 
 
 		 338 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  95.86 
 
 		 338 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  95.27 
 
 		 338 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  95.86 
 
 		 338 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.62 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.92 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.92 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.92 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.92 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  54.9 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  51.18 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  46.73 
 
 		 336 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.1 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  37.86 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.54 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.54 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.54 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.58 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.73 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.81 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.81 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  43.45 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.81 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.51 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  35.13 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  36.64 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  33.12 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  33.12 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  33.12 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  33.12 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  32.81 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  32.81 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  33.12 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  30.06 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  42.65 
 
 		 167 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  27.24 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  27.24 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  30.67 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  27.6 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 272 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  26.64 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  28.4 
 
 		 275 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  27.97 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  25.72 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 272 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  28.4 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  23.51 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  27.85 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  27.31 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  27.41 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  28.52 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  23.77 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  25.55 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 		 630 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  26.25 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  25.72 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  23.81 
 
 		 1014 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  25.98 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  24.03 
 
 		 697 aa  67  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  23.31 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  21.43 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  26.55 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  24.91 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.37 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  21.72 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.16 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0711  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  26.9 
 
 		 615 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  22.85 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  27.52 
 
 		 602 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  27.32 
 
 		 610 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0995  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.93 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.215731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.38 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>