48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0060 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  29.73 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  27.27 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  25.64 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.39 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  29.26 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  25.3 
 
 
347 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  22.61 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  27.31 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  25 
 
 
371 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.5 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  26.94 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  23.61 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.69 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.69 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  26.58 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.69 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.69 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.23 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  22.95 
 
 
336 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
316 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.12 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  27.59 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  28.75 
 
 
339 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
334 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
331 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  28.12 
 
 
358 aa  46.2  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.2 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.2 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  25.2 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  25.6 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  23.77 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  26.1 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.25 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  31.85 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.12 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  28.05 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  28.05 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.05 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  27.27 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.05 
 
 
338 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  19.54 
 
 
1014 aa  42.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.2 
 
 
317 aa  42  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>