42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2334 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2334  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 317 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 630 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  25.33 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.57 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  23.75 
 
 		 1014 aa  77  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.32 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  27.08 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0994  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.85 
 
 		 759 aa  66.2  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.624995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  21.68 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  23.21 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  22.62 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  20.45 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  23.08 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  22.11 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.19 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  22.07 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  25.89 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  24.52 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  24.04 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  20.65 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  21.45 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  25 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  22.4 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  22.58 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  19.24 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  18.65 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  18.65 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  18.65 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  18.65 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0995  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.17 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.215731  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  23.81 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.58 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  22.4 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  22.4 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  20.28 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  22.4 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>