73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3091 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  100 
 
 		 178 aa  343  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  58.43 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  51.9 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  51.27 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  49.37 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  32.72 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  35.14 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  39.68 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  32.8 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  30.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  28.07 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.21 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  26.28 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  28.46 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  30.16 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  32.59 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  36.97 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  36.72 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  31.71 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  33.94 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  31.07 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  35.85 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3242  colicin V production protein  21.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00343248  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3405  hypothetical protein  33.08 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  28.28 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  35.78 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  24.86 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  22.78 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4664  cvpA family protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0457781  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  33.94 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  32.08 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4667  cvpA family protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000766782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4449  cvpA family protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4298  colicin V production protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000698337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4796  cvpA family protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0185853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4287  colicin V production protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4680  cvpA family protein  21.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0235312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  25.17 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0574  cvpA family protein  20.81 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000461155  normal  0.549376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4680  cvpA family protein  21.48 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000294849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  22.09 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  28.19 
 
 		 234 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4382  colicin V production protein  22.37 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  28.93 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  23.56 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  24.62 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  34.78 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  27.12 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  30.2 
 
 		 197 aa  44.3  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  22.4 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  29.56 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  29.63 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  29.56 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  26.56 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  29.09 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  30.77 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  28.57 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  30.06 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  25.62 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  29.89 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  21.6 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  28.44 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  27.97 
 
 		 160 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  31.11 
 
 		 189 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  31.78 
 
 		 195 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  28.44 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  30.53 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  32.67 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2634  Colicin V production protein  18.95 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105324  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  24.55 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  31.48 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  27.93 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>