82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0129 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  38.66 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  34.31 
 
 
206 aa  121  6e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0841  CvpA family protein  34.39 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.697503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  20.92 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  27.61 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  20.73 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  20.21 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  26.87 
 
 
177 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  29.31 
 
 
166 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  30.17 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  29.31 
 
 
166 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  21.78 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  29.31 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  34.95 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  29.91 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  21.02 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  29.09 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  30.17 
 
 
163 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  20.71 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  31.62 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  26.72 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  31.62 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  27.59 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  28.45 
 
 
163 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  27.59 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  27.59 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  31.62 
 
 
162 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  27.12 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  27.21 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  21.18 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  27.59 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  28.47 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  18.95 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  25.22 
 
 
158 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  26.47 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  26.47 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  26.47 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  26.47 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  26.47 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  20.2 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  26.47 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  26.47 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  26.47 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  29.31 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  31.03 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  31.03 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  20.2 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  30.17 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  27.21 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  30.17 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  27.21 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  27.21 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  27.21 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  30.17 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  27.21 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  30.17 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  30.25 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  22.69 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  26.75 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  30.17 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  28.97 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  20.3 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  31.03 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  22.05 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  24.62 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  19.27 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.77 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  21.12 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  30.17 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1711  colicin V production protein  22.96 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  25.93 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  22.34 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  21.05 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  29.06 
 
 
162 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  21.47 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  30.17 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  19.7 
 
 
214 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  21.24 
 
 
193 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  22.11 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  21.19 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  24.28 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>