116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3077 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  100 
 
 		 158 aa  306  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  72.61 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  40.65 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  42.58 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  42.04 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  36.77 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  32.19 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  26.8 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  27.45 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  25.49 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  32.48 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  31.06 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  26.87 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  32.41 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  33.55 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  29.25 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  29.61 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  29.61 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  31.13 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  34.39 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  31.85 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  29.3 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  28.29 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  31.25 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  28.66 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  27.67 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  27.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.56 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  29.61 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  30.56 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  31.16 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  28.66 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  29.86 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  31.13 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  32.68 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  31.16 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  33.12 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  33.56 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  29.41 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  28.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  33.12 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  27.67 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  28.03 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  30.06 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  32.47 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  24.84 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  26.32 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  27.67 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  29.22 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  32.47 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  30.46 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  29.8 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  29.8 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  31.82 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  25.79 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  29.8 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  27.85 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  30.52 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  29.81 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  30.43 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  30.43 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  30.43 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  29.14 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  29.14 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  29.09 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  29.22 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  27.92 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  25.22 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  30.49 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  30.86 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  30.86 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  28.57 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  24.38 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  26.87 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  26.87 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  27.63 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  35.83 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  25.81 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  28.29 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  29.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  25.81 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  26.45 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  28.3 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1277  Colicin V production protein  31.07 
 
 		 414 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  25.81 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  34.23 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  25.38 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>