151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02505 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  100 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1024  colicin V production protein  59.29 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0900  colicin V production protein  57.14 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0811  Colicin V production protein  46.21 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.270792  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  34.44 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  31.97 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  33.1 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  35.62 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  31.97 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  31.37 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  31.97 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  35.62 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  32.19 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  31.58 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  36.84 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  32.89 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  31.72 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  33.55 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  30.82 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  36.69 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  35 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  26.97 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  26.97 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  34.25 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  36.77 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  32.41 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  28.96 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.67 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  33.33 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  31.65 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  26.22 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  30.26 
 
 		 166 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  32.45 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  29.71 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  33.58 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  32.05 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  30.26 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  29.49 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  31.33 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  31.54 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  31.13 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  36.24 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  30 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  30.26 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  30.26 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  30.26 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  29.61 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  30.06 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  28.22 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  29.8 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  32.12 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  32.85 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  26.4 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  33.33 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  27.63 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  27.63 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  27.63 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  27.63 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  27.63 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  27.63 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  27.63 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  32.39 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  31.39 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  32.85 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  32 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  28.29 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  28.85 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  31.39 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  26.67 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  31.39 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  29.32 
 
 		 163 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  29.61 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  31.65 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  30.92 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  27.63 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  31.65 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  34.65 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  30.16 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  29.8 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  29.14 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  29.14 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  26.92 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  29.14 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  29.14 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  31.54 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  28.57 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  31.54 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>