179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0917 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  100 
 
 		 166 aa  329  9e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  59.88 
 
 		 166 aa  206  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  59.63 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  60.25 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  61.88 
 
 		 162 aa  203  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  59.63 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  59.63 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  59.63 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  59.24 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  58.6 
 
 		 163 aa  197  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  58.6 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  58.13 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  57.32 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  57.32 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  57.32 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  57.32 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  57.32 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  57.32 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  56.25 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  56.25 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  56.25 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  56.25 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  56.25 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  57.96 
 
 		 163 aa  193  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  193  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  56.17 
 
 		 163 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  55.56 
 
 		 163 aa  191  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  56.69 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  54.72 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  52.47 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  52.53 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  54.78 
 
 		 166 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  54.78 
 
 		 162 aa  180  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  54.78 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  54.14 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  54.14 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  54.14 
 
 		 162 aa  177  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  52.87 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  52.87 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  52.87 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  53.5 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  52.87 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  43.64 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  47.13 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  45.75 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  45.89 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  46.21 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  47.62 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  46.21 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  44.9 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  46.21 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  41.1 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  45.89 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  43.45 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  43.45 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  43.45 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  43.54 
 
 		 180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  43.54 
 
 		 184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  44.22 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  48.03 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  35.48 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  35.48 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  35.48 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  40.14 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  41.73 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  44.88 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  44.88 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  37.5 
 
 		 165 aa  87.8  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  37.5 
 
 		 165 aa  87.8  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  37.59 
 
 		 161 aa  87.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  35.92 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  37.68 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  37.32 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  35.29 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  33.33 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  32.34 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  35.04 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  33.53 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  36.5 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  34.56 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  30.07 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  31.74 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  35.07 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  37.04 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  36.69 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  35.56 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  33.1 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  29.58 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  28.17 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  31.94 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  33.1 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  27.98 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  30.41 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  26.44 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  33.78 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>