74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0510 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  44.75 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  40.65 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  38.06 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  40 
 
 		 155 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  36.13 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  33.55 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  29.38 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  28.25 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  28.83 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  30.32 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  28.85 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  26.99 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  28.29 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  32.8 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  30.25 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1277  Colicin V production protein  31.82 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  32.58 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  26.06 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  27.87 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  22.49 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  32.85 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  32.17 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  30 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  25.79 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  30.56 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2735  Colicin V production protein  26.11 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.87 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  33.33 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  32.54 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  33.33 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  31.01 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  31.97 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  22.94 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  29.57 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  30 
 
 		 169 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  35.9 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  30.25 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  29.38 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  25.67 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  30.08 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  31.65 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  32.64 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  22.99 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  32.31 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  29.66 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  25.16 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  29.09 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  23.73 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  25.32 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  25.45 
 
 		 248 aa  44.7  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  26.03 
 
 		 181 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  28.66 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  25.69 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  22.69 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  28.66 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  29.13 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  28.1 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  27.92 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1805  colicin V production protein  26.19 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  29.86 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  22.5 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  27.27 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  25 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  27.13 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  27.78 
 
 		 189 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  31.58 
 
 		 167 aa  42  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  25.81 
 
 		 216 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  28.99 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  26.13 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  25.71 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  26.19 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  26.25 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>