15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2735 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2735  Colicin V production protein  100 
 
 
196 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0932  Colicin V production protein  28.92 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  28.72 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  27.17 
 
 
177 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  27.17 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1277  Colicin V production protein  24.49 
 
 
414 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  30.89 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  22.66 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  26.61 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  19.77 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  21.85 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  22.11 
 
 
238 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  25.4 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  23.91 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  29.41 
 
 
196 aa  42  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>