158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2194 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  44.75 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  38.71 
 
 		 155 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  36.77 
 
 		 158 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  30.41 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  37.42 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  28.8 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  32.48 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  31.61 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  29.88 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  28.66 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  32.45 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  30.65 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  38.19 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  30.19 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  30 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  34.01 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  37.9 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  32.65 
 
 		 162 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  25.9 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  25.3 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  26.17 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  27.5 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  25.47 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  28.49 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  26.45 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  26.74 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  25.32 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  30.95 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  23.9 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  31.61 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  27.86 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  31.09 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.56 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  28.48 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  27.85 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  28.76 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  27.85 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  27.85 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  27.85 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  27.85 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  27.22 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  25.71 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  33.04 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  27.22 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  26.58 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  25.64 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  24.14 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  25.64 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  29.38 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  24.68 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  31.07 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  28.43 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  24.38 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  30 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  30.34 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  30.07 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  30.07 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  29.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  25.95 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  25.31 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  23.93 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2130  putative colicin V production protein  27.67 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1277  Colicin V production protein  29.09 
 
 		 414 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  26.09 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  24.84 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  28.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  32.84 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  29.29 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  29.29 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  30.19 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  21.55 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  26.09 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  29.66 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  24.84 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  25 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  28.22 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  29.75 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  28.37 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  24.63 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  27.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  27.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  27.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  27.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  27.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  32.38 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  27.86 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  27.86 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  27.86 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  26.25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  27.86 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  24.35 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  29.75 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  27.82 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>