50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05660 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  100 
 
 
163 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  30.57 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  27.21 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  25.62 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  27.01 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2634  Colicin V production protein  25.32 
 
 
179 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  26.92 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0822  Colicin V production protein  27.59 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3405  hypothetical protein  31.25 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  30.58 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  30.7 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  26.36 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  28.93 
 
 
162 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  26.92 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  25.24 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  27.87 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  27.1 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  24.31 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  27.89 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  26.61 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2566  colicin V production protein  29.17 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  30.49 
 
 
165 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  25 
 
 
163 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  29.63 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  25.16 
 
 
173 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  26.11 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  29.81 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  27.68 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4382  colicin V production protein  25.48 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  28.04 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3242  colicin V production protein  24.2 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00343248  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0425  hypothetical protein  22.42 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  30.25 
 
 
196 aa  44.3  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  24.36 
 
 
155 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  25.41 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0574  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000461155  normal  0.549376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  25.38 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1726  Colicin V production protein  29.82 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4449  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  22.4 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4298  colicin V production protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000698337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4796  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0185853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4667  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000766782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4664  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0457781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4680  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000294849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4287  colicin V production protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4680  cvpA family protein  24.2 
 
 
179 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0235312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  26.32 
 
 
189 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  26.92 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  30.93 
 
 
163 aa  40.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>