35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0822 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0822  Colicin V production protein  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2634  Colicin V production protein  77.27 
 
 		 179 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4382  colicin V production protein  39.29 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3242  colicin V production protein  39.88 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00343248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0574  cvpA family protein  39.29 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000461155  normal  0.549376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4680  cvpA family protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0235312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4449  cvpA family protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4287  colicin V production protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4298  colicin V production protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000698337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4667  cvpA family protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000766782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4796  cvpA family protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0185853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4664  cvpA family protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0457781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4680  cvpA family protein  38.69 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000294849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1810  hypothetical protein  35.33 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000641014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0425  hypothetical protein  26.28 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0725  bacteriocin production protein, putative  27.22 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.59 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1201  hypothetical protein  26.28 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1223  hypothetical protein  26.28 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0537  colicin V production protein  23.84 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000190981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  22.76 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1738  membrane ancor connecting MutS2 with cell-division Z-ring  22.16 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  27.97 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  21.51 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  27.89 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  25.16 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  24.86 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1720  hypothetical protein  24.85 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  25.16 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  23.73 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0053  hypothetical protein  26.88 
 
 		 233 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00220194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  23.87 
 
 		 162 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  25.87 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  27.21 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  22.29 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>