29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2634 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2634  Colicin V production protein  100 
 
 
179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0822  Colicin V production protein  77.27 
 
 
179 aa  247  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3242  colicin V production protein  45.12 
 
 
179 aa  157  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00343248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4382  colicin V production protein  45.12 
 
 
179 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0574  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000461155  normal  0.549376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4680  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0235312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4667  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000766782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4449  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4287  colicin V production protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4298  colicin V production protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000698337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4664  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0457781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4680  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000294849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4796  cvpA family protein  43.9 
 
 
179 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0185853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1810  hypothetical protein  33.89 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000641014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0425  hypothetical protein  26.99 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1201  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1223  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1738  membrane ancor connecting MutS2 with cell-division Z-ring  25 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0725  bacteriocin production protein, putative  26.28 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0537  colicin V production protein  24.1 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000190981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  25.29 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1720  hypothetical protein  24.39 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  31.47 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  25.93 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  25.93 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  19.53 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  25.42 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  24.34 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  26.72 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>