26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0823 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  350  5e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1130  hypothetical protein  43.21 
 
 
169 aa  127  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.242385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  27.93 
 
 
181 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4730  Colicin V production protein  27.84 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3405  hypothetical protein  28.12 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  30.32 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1046  Colicin V production protein  22.81 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  31.25 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  26.38 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  24.22 
 
 
248 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.76 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  30.63 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  24.84 
 
 
158 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  31.71 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  28.49 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  22.22 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  27.38 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  27.63 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  26.35 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  28.04 
 
 
163 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  35.71 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  26.79 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  28.67 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  35.78 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  30.59 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  24.38 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>