19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0932 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0932  Colicin V production protein  100 
 
 		 185 aa  348  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2735  Colicin V production protein  29.67 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  25 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  28.97 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  25.53 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  25.53 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  26.24 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  22.29 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  22.42 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  21.62 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  28.57 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  25.47 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  26.72 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  23.2 
 
 		 203 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0256  CvpA family protein  23.85 
 
 		 163 aa  42  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  23.33 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  25.47 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  28.47 
 
 		 218 aa  41.6  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  25 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>