115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4382 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.03 
 
 
604 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3094  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.55 
 
 
598 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.426752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3897  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.89 
 
 
609 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0833  phosphoenolpyruvate carboxykinase  77.64 
 
 
607 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.961355  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4382  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 
472 aa  968    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.88 
 
 
617 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2819  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  75.67 
 
 
604 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000209733  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5171  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.5 
 
 
606 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0325265  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4211  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  73.84 
 
 
614 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16117  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8530  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  72.73 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741618  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4143  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  72.75 
 
 
605 aa  611  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4475  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  67.88 
 
 
608 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.475526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.58 
 
 
605 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00158332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4422  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.55 
 
 
618 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0707425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4876  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  68.78 
 
 
604 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0201  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.51 
 
 
609 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3577  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.7 
 
 
618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0451  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.54 
 
 
609 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.54 
 
 
606 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.116836  normal  0.471876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4179  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.04 
 
 
621 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0030  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.55 
 
 
618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3420  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.06 
 
 
618 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0476  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  70.48 
 
 
608 aa  578  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540032  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0212  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.83 
 
 
597 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0812521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0176  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.05 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0185  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.05 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.05 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4337  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.8 
 
 
621 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171567  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0304  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.81 
 
 
618 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39080  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.15 
 
 
608 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.377396  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0665  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.83 
 
 
614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3922  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.3 
 
 
621 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.55 
 
 
621 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309168  normal  0.0994612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.3 
 
 
621 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0017  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.15 
 
 
622 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.982063  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1511  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.81 
 
 
621 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0731  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  66.34 
 
 
611 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.06 
 
 
621 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0061457  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.15 
 
 
622 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0372  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  65.31 
 
 
614 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3416  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.15 
 
 
622 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
621 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1574  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
621 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2808  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.59 
 
 
621 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0495385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1250  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
621 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1673  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.42 
 
 
592 aa  566  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136297  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0620  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
621 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.755794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1446  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
621 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1475  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
621 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0533  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.34 
 
 
616 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.61 
 
 
612 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0031  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.38 
 
 
621 aa  565  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3419  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.6 
 
 
620 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.88 
 
 
612 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.473448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1092  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.77 
 
 
615 aa  558  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.28153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6994  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.07 
 
 
603 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2799  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  67.68 
 
 
616 aa  555  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2012  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.6 
 
 
630 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3705  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.34 
 
 
625 aa  557  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0052  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.59 
 
 
622 aa  557  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.96 
 
 
620 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0621  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  65.6 
 
 
632 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.655459  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3385  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.42 
 
 
618 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0023  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.36 
 
 
621 aa  554  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.162015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2638  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.83 
 
 
617 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000194383  normal  0.814307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0050  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.11 
 
 
617 aa  551  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0051  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.11 
 
 
621 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0102  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.11 
 
 
622 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.999469  normal  0.0413186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0870  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.08 
 
 
617 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00431316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2496  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.01 
 
 
619 aa  549  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3462  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.01 
 
 
616 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00146202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3060  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.29 
 
 
611 aa  549  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0160  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.83 
 
 
622 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000637249  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0667  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.06 
 
 
611 aa  545  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0190  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.65 
 
 
614 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0138  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.72 
 
 
620 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0717765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2846  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.76 
 
 
619 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3945  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.49 
 
 
624 aa  547  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0033  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.27 
 
 
619 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00652728  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.77 
 
 
647 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0749  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.52 
 
 
647 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5314  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.12 
 
 
647 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.77 
 
 
621 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.3 
 
 
625 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310577  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0814  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.46 
 
 
616 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0114  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.5 
 
 
621 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06760  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  63.61 
 
 
646 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0429  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.46 
 
 
609 aa  535  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.04 
 
 
621 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.401418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0386  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  68.41 
 
 
619 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0901  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.93 
 
 
616 aa  531  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0078  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.44 
 
 
623 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0718  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.75 
 
 
608 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0097  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.44 
 
 
623 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03380  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.46 
 
 
614 aa  532  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.72 
 
 
608 aa  528  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.96 
 
 
584 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584132  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_002620  TC0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.46 
 
 
599 aa  500  1e-140  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2479  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.6 
 
 
597 aa  500  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.215275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3601  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.55 
 
 
655 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>