115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3416 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4876  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  59.7 
 
 		 604 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.2 
 
 		 599 aa  702    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3385  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.8 
 
 		 618 aa  836    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0017  phosphoenolpyruvate carboxykinase  92.77 
 
 		 622 aa  1217    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.982063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1030    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0665  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.48 
 
 		 614 aa  924    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.36 
 
 		 604 aa  763    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3420  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.89 
 
 		 618 aa  1117    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1574  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0386  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.57 
 
 		 619 aa  729    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1511  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1017    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0023  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.25 
 
 		 621 aa  844    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.162015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2012  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67 
 
 		 630 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2638  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.64 
 
 		 617 aa  843    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000194383  normal  0.814307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3419  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.61 
 
 		 620 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2808  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.47 
 
 		 621 aa  1032    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0495385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.49 
 
 		 596 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3897  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.09 
 
 		 609 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0160  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.76 
 
 		 622 aa  981    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000637249  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4422  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.8 
 
 		 618 aa  1077    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0707425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3577  phosphoenolpyruvate carboxykinase  84.54 
 
 		 618 aa  1111    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.03 
 
 		 584 aa  787    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584132  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3922  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.79 
 
 		 621 aa  1019    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0176  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.49 
 
 		 609 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.28 
 
 		 621 aa  1016    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309168  normal  0.0994612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0667  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.95 
 
 		 611 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.79 
 
 		 621 aa  1019    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0901  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.92 
 
 		 616 aa  773    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0051  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.94 
 
 		 621 aa  839    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2799  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  67.05 
 
 		 616 aa  841    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0190  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.88 
 
 		 614 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0731  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  59.05 
 
 		 611 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2479  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.09 
 
 		 597 aa  710    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.215275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0185  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.49 
 
 		 609 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0201  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.35 
 
 		 609 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0138  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.64 
 
 		 620 aa  982    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0102  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.28 
 
 		 622 aa  975    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.999469  normal  0.0413186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0078  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.04 
 
 		 623 aa  968    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1250  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1030    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1673  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.89 
 
 		 592 aa  761    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3705  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.4 
 
 		 625 aa  996    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0620  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1030    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.755794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.53 
 
 		 605 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00158332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1446  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1475  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 621 aa  1030    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.49 
 
 		 609 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0533  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.89 
 
 		 616 aa  1030    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0451  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.34 
 
 		 609 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.98 
 
 		 621 aa  975    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.04 
 
 		 612 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.473448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8530  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.67 
 
 		 614 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741618  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0870  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.39 
 
 		 617 aa  839    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00431316  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5171  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.42 
 
 		 606 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0325265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2496  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.5 
 
 		 619 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.54 
 
 		 606 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.116836  normal  0.471876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.02 
 
 		 625 aa  706    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310577  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3803  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.32 
 
 		 595 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2846  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.33 
 
 		 619 aa  806    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0833  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.48 
 
 		 607 aa  769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.961355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0621  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  65.56 
 
 		 632 aa  829    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.655459  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06760  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  56.59 
 
 		 646 aa  708    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.37 
 
 		 612 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4211  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  66.78 
 
 		 614 aa  820    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16117  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0429  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.45 
 
 		 609 aa  841    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0114  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.72 
 
 		 621 aa  970    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4179  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.87 
 
 		 621 aa  1029    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.79 
 
 		 621 aa  1018    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0061457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3945  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.32 
 
 		 624 aa  984    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.14 
 
 		 621 aa  974    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.401418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4337  phosphoenolpyruvate carboxykinase  78.63 
 
 		 621 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0718  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.74 
 
 		 608 aa  801    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0030  phosphoenolpyruvate carboxykinase  82.29 
 
 		 618 aa  1082    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.55 
 
 		 608 aa  768    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0304  phosphoenolpyruvate carboxykinase  81.96 
 
 		 618 aa  1076    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  98.87 
 
 		 622 aa  1280    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0031  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.44 
 
 		 621 aa  865    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3462  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.17 
 
 		 616 aa  835    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00146202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0033  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.66 
 
 		 619 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00652728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0052  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.16 
 
 		 622 aa  851    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0050  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.07 
 
 		 617 aa  841    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.33 
 
 		 596 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.2 
 
 		 647 aa  808    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1092  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.03 
 
 		 615 aa  927    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.28153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3060  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69 
 
 		 611 aa  870    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0814  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.28 
 
 		 616 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3817  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.33 
 
 		 596 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.799264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0212  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.44 
 
 		 597 aa  722    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0097  phosphoenolpyruvate carboxykinase  75.04 
 
 		 623 aa  968    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.96 
 
 		 588 aa  689    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3601  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.44 
 
 		 655 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  76.44 
 
 		 620 aa  1007    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03380  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.07 
 
 		 614 aa  667    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3416  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 622 aa  1289    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0749  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.2 
 
 		 647 aa  808    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6994  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.64 
 
 		 603 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0693  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.05 
 
 		 598 aa  662    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.39 
 
 		 617 aa  783    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39080  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.32 
 
 		 608 aa  718    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.377396  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5314  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.74 
 
 		 647 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4475  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  60.17 
 
 		 608 aa  763    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.475526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>