115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1782 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4876  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  55.16 
 
 		 604 aa  698    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.22 
 
 		 599 aa  677    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3385  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.68 
 
 		 618 aa  805    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0017  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.32 
 
 		 622 aa  970    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.982063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0665  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.72 
 
 		 614 aa  858    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.03 
 
 		 604 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3420  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.61 
 
 		 618 aa  961    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1574  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0386  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  54.7 
 
 		 619 aa  668    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1511  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.97 
 
 		 621 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.717731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0023  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.83 
 
 		 621 aa  804    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.162015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2012  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.56 
 
 		 630 aa  792    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2638  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.94 
 
 		 617 aa  800    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000194383  normal  0.814307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3419  phosphoenolpyruvate carboxykinase  60.66 
 
 		 620 aa  772    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2808  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.77 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0495385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3676  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.07 
 
 		 596 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3897  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.25 
 
 		 609 aa  761    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0160  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.37 
 
 		 622 aa  949    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000637249  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4422  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.81 
 
 		 618 aa  922    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0707425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3577  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.02 
 
 		 618 aa  967    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.87 
 
 		 584 aa  733    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584132  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3922  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.52 
 
 		 621 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0176  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.87 
 
 		 609 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3877  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.33 
 
 		 621 aa  921    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309168  normal  0.0994612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0621  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  61.79 
 
 		 632 aa  794    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.655459  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.52 
 
 		 621 aa  925    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0901  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.64 
 
 		 616 aa  738    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0051  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.8 
 
 		 621 aa  783    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4211  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  61.92 
 
 		 614 aa  779    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16117  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0190  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.65 
 
 		 614 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0731  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  55.01 
 
 		 611 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2479  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  53.96 
 
 		 597 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.215275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0185  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.87 
 
 		 609 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0201  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.77 
 
 		 609 aa  727    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0138  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.72 
 
 		 620 aa  943    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0102  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.54 
 
 		 622 aa  952    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.999469  normal  0.0413186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0078  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.02 
 
 		 623 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1250  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1673  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.79 
 
 		 592 aa  720    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3705  phosphoenolpyruvate carboxykinase  72.1 
 
 		 625 aa  945    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0620  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.755794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.58 
 
 		 605 aa  741    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00158332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1446  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1475  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 621 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.87 
 
 		 609 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0533  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.28 
 
 		 616 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0451  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.44 
 
 		 609 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2083  phosphoenolpyruvate carboxykinase  96.62 
 
 		 621 aa  1249    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.92 
 
 		 612 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.473448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8530  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  56.15 
 
 		 614 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741618  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0870  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.96 
 
 		 617 aa  789    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00431316  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5171  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.84 
 
 		 606 aa  734    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0325265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2496  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.64 
 
 		 619 aa  788    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  55.97 
 
 		 606 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.116836  normal  0.471876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3537  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.81 
 
 		 625 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310577  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3803  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.74 
 
 		 595 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2846  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.32 
 
 		 619 aa  784    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0833  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.18 
 
 		 607 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.961355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0476  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  58.76 
 
 		 608 aa  751    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06760  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  52.36 
 
 		 646 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0807  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.09 
 
 		 612 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2799  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  62.13 
 
 		 616 aa  797    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0429  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.3 
 
 		 609 aa  801    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0114  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.2 
 
 		 621 aa  938    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4179  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.45 
 
 		 621 aa  928    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5861  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.52 
 
 		 621 aa  925    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0061457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3945  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.97 
 
 		 624 aa  937    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1782  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 621 aa  1286    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.401418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4337  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.33 
 
 		 621 aa  920    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0718  phosphoenolpyruvate carboxykinase  59.34 
 
 		 608 aa  744    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0030  phosphoenolpyruvate carboxykinase  70.31 
 
 		 618 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.26 
 
 		 608 aa  737    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0304  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.48 
 
 		 618 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3739  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.26 
 
 		 622 aa  977    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0031  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.97 
 
 		 621 aa  806    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3462  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.48 
 
 		 616 aa  785    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00146202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0033  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.52 
 
 		 619 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00652728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0052  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.56 
 
 		 622 aa  800    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0050  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.06 
 
 		 617 aa  790    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.74 
 
 		 596 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.3 
 
 		 647 aa  785    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1092  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.9 
 
 		 615 aa  838    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.28153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3060  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.17 
 
 		 611 aa  806    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0372  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  57.7 
 
 		 614 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3817  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.74 
 
 		 596 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.799264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0212  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.16 
 
 		 597 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0097  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.02 
 
 		 623 aa  926    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4143  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  56.4 
 
 		 605 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3601  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.25 
 
 		 655 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  73.92 
 
 		 620 aa  978    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03380  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.02 
 
 		 614 aa  635    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3416  phosphoenolpyruvate carboxykinase  74.14 
 
 		 622 aa  974    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0749  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.3 
 
 		 647 aa  785    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6994  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.8 
 
 		 603 aa  668    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3094  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.17 
 
 		 598 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.426752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0734  phosphoenolpyruvate carboxykinase  57.55 
 
 		 617 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39080  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.8 
 
 		 608 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.377396  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5314  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.72 
 
 		 647 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4475  Phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  55.52 
 
 		 608 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.475526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>