46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3648 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  100 
 
 		 376 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  59.78 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  46.54 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  43.5 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.8 
 
 		 347 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  45.65 
 
 		 334 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.86 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  43.75 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  45.23 
 
 		 370 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.56 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.62 
 
 		 335 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  43.82 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  46.85 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.67 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.12 
 
 		 335 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.12 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  40.7 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  40.4 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  38.81 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  36.39 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  38.54 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  36.74 
 
 		 336 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  36.74 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.9 
 
 		 336 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  43.73 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  37.6 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  39.85 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  41.3 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  33.69 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  39.24 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  33.51 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  35.99 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  37.13 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  34.68 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  39.33 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  29.66 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  24.29 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  24.46 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  24.46 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  39.34 
 
 		 357 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  24.18 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  58.62 
 
 		 1407 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  20.49 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  23.51 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>