49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1312 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  100 
 
 		 335 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  55.29 
 
 		 342 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  57.32 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  55.38 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  53.13 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  54.52 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  54.06 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  50.91 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  50.46 
 
 		 370 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  52.22 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  52.83 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.55 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.88 
 
 		 338 aa  261  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.73 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  50.92 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  51.23 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.91 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  44.27 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.05 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.34 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  51.29 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.94 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.54 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  42.9 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  41.87 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  40.96 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  38.49 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  45.45 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.49 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  38.44 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  43.19 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  42.29 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  32.22 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  31.75 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  31.21 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  31.91 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  27.65 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  27.11 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  26.1 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  26.19 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  24.42 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  24.37 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  24.78 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  23.55 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  23.05 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  24.49 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  22.44 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  26.38 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  22.66 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>