42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1450 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  718    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  56.13 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  56.56 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  50.42 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  44.16 
 
 		 357 aa  292  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  40.74 
 
 		 355 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  36.06 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  36.99 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  37.28 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  37.46 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  33.05 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  31.44 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  26.7 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  27.97 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  28.37 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  30.17 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  31.07 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  26.74 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  24.15 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.67 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  28.69 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  28.36 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.43 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.43 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.43 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.51 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  26.7 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  29.49 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  29.9 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.04 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  25.88 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.85 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.4 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.84 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  25.15 
 
 		 362 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  26.44 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  28.7 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.38 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  55 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  29.57 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  28.5 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>