36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1037 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  725    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  56.13 
 
 
361 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  50.73 
 
 
350 aa  345  7e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  45.66 
 
 
355 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  42.05 
 
 
355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  41.48 
 
 
357 aa  292  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  35.67 
 
 
356 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  32.21 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  33.13 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  33.13 
 
 
343 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  32.83 
 
 
342 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  32.34 
 
 
344 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  29.97 
 
 
346 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  27.3 
 
 
341 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  26.69 
 
 
342 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  27.83 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  27.04 
 
 
358 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  25.84 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  24.79 
 
 
346 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  22.6 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.96 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.96 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.96 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.83 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  21.97 
 
 
342 aa  56.6  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.31 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  23.83 
 
 
311 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  22.16 
 
 
372 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.56 
 
 
336 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  21.79 
 
 
362 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  25 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  21.65 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.66 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  20.49 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  21.76 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  25.57 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>