49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_457 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  98.83 
 
 		 342 aa  705    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  92.71 
 
 		 343 aa  641    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  100 
 
 		 342 aa  712    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  38.48 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  35.28 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  36.42 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  31.31 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  31.75 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  32.75 
 
 		 355 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  32.65 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  35.41 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  33.93 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  32.09 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  33.13 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  30.72 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  29.5 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  30.7 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  28.78 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  26.57 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  28.17 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.13 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.55 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.55 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.55 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  21.45 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.66 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  25.3 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.78 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.55 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  27.89 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.22 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.37 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  23.08 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.74 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  24.55 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.65 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  22.36 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0034  methionine synthase  25.88 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.887415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.16 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.41 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.78 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.58 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.31 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0104  methionine synthase  24.88 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.653377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1388  methionine synthase  25.93 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.53519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  22.03 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  24.9 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.78 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  22.97 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>