46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4087 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  100 
 
 		 345 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  57.98 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  57.36 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  54.55 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  56.71 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  49.4 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  52.02 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  50.62 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  49.31 
 
 		 376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  52.22 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  50.61 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  50.15 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.85 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  51.53 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  54.21 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  53.27 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.71 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  46.69 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  42.51 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  43.36 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.9 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.53 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.53 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.04 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  44.79 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.86 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.94 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  39.24 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.88 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  41.9 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  37.75 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  36.5 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  46.59 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  38.75 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  24.32 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  26.92 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  24.55 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  23.87 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  26.18 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  26.14 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  27.5 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  26.56 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.12 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  24.45 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>