37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_14780 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  680    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  52.74 
 
 
341 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  53.23 
 
 
354 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  48.56 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  47.47 
 
 
362 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  37.04 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  45.5 
 
 
337 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  45.62 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.29 
 
 
335 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  45.05 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  46.59 
 
 
345 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  40.19 
 
 
362 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  44.94 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  33.15 
 
 
372 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  43.22 
 
 
335 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  45.6 
 
 
335 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  35.68 
 
 
370 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.09 
 
 
338 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  41.41 
 
 
335 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.44 
 
 
335 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  38.38 
 
 
339 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.13 
 
 
376 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  38.95 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  39.39 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  40.93 
 
 
336 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.64 
 
 
335 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.81 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.81 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.81 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  34.7 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  42.95 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  40 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  33.54 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  34.91 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  35.48 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.23 
 
 
1277 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  37.23 
 
 
1277 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>