38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2840 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  100 
 
 		 335 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  73.21 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  61.93 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  55.92 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  53.69 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  57.61 
 
 		 344 aa  335  7e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  54.76 
 
 		 372 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  55.38 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  54.55 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.75 
 
 		 376 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  50.59 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  47.37 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  50.62 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.25 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  50.3 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  50.9 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  44.59 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.14 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  42.73 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  42.01 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.47 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.03 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.03 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.41 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.72 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.17 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  41.09 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  40.24 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  38.66 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  39.24 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  37.17 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  35.59 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  31.41 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  41.41 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  32.17 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  24.9 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  24.9 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>