43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  100 
 
 		 362 aa  705    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  64.9 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  54.05 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  51.91 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  51.45 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  50.91 
 
 		 335 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  50.59 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  49.44 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.99 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  50.15 
 
 		 345 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  49.56 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  47.21 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  48.81 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  49.08 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  49.08 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.74 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  45.81 
 
 		 370 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.77 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.32 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  46.73 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  50 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  51.5 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  43.03 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.64 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  45.19 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  41.57 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  47.01 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  38.7 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  40.97 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  40.98 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  47.47 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  31.45 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  33.68 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  26.3 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  26.15 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  36.76 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  31.1 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  22.98 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  22.36 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  22.5 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  23.8 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  27.2 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>