48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1215 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  100 
 
 		 335 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  89.55 
 
 		 335 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  56.36 
 
 		 370 aa  348  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  58.79 
 
 		 337 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  53.31 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  54.22 
 
 		 334 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  52.45 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  52.54 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  53.25 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  48.82 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  51.49 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  53.21 
 
 		 362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  51.94 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.58 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  48.8 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  52.57 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  45.15 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.85 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.42 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.98 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.98 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.98 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.07 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.87 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  43.52 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  41.9 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  42.15 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  40.72 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  38.85 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  38.66 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  36.72 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  46.15 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  37.39 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  30.15 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  42.52 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  23.85 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  24.61 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  25.15 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  24.54 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  29.76 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  24.73 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  24.49 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  27.78 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  25.58 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  24.35 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  24.71 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  29.14 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1385  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  24.54 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.25974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>