48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0602 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  66.47 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  55.75 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  57.74 
 
 		 334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  55.92 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  54.71 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  55.29 
 
 		 335 aa  335  7.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  50 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.4 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.92 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.5 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  47.21 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  47.95 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  46.04 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  47.18 
 
 		 335 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.18 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  47.46 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.93 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.64 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.9 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.9 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  40 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.24 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  41.52 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.85 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  40.06 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  39.18 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  38.34 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  38.69 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  36.58 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  37.92 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  44.28 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  32.6 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  31.89 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  22.65 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  26.76 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  26.7 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  27.16 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  21.97 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  23.08 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  23.1 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  24.1 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  27.12 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  21.33 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  24.1 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  22.7 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  23.01 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>