46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3253 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  100 
 
 		 336 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.87 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.37 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  47.37 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.06 
 
 		 336 aa  248  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.27 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.29 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  43.53 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  43.16 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.87 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.99 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.81 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  42.86 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  41.69 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.51 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  40.6 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  41.89 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.77 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  40.43 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  38.82 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  36.36 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  42.22 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  41.49 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  36.36 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  36.91 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  40.2 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  33.13 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  37.25 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  41.75 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  36.04 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  32.35 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  36.45 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  24.72 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  28.33 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  24.34 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  24.78 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  23.96 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  24.74 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  21.53 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  30.66 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  30.16 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  25.96 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  26.07 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>