24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1397 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  700    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  46.59 
 
 
342 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  45.24 
 
 
341 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  28.78 
 
 
342 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  28.78 
 
 
342 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  29.69 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  27.78 
 
 
346 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  27.73 
 
 
344 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  30.82 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  27.3 
 
 
354 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  27.17 
 
 
356 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  25.93 
 
 
355 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  27.32 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  27.64 
 
 
350 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  24.93 
 
 
346 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  24.85 
 
 
346 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  26.74 
 
 
361 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  24.25 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  24.13 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  24.46 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  23.11 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.96 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  30.16 
 
 
336 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  29.87 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>