32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2249 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  37.66 
 
 		 454 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  37.24 
 
 		 498 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  37.5 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  35.79 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  34.82 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  37.06 
 
 		 471 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  35.73 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  32.43 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  34.84 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  38.42 
 
 		 442 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  30.18 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  33.42 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  31.2 
 
 		 501 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  34.56 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  30.84 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  30.67 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  34.49 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  31.96 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  30.32 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  31.2 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  34.55 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  30.31 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  33.43 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  32.41 
 
 		 723 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  31.78 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  31.23 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  31.23 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  31.33 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  29.27 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  27.75 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  31.48 
 
 		 128 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>