32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2991 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  100 
 
 
471 aa  888    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  89.6 
 
 
471 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  56.22 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  46.22 
 
 
443 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  44.33 
 
 
454 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  44.86 
 
 
442 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  37.08 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  35.51 
 
 
462 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  39.01 
 
 
433 aa  176  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  32.22 
 
 
501 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  36.14 
 
 
400 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  34.57 
 
 
435 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  35.29 
 
 
438 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  33.67 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  33.85 
 
 
442 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  34.78 
 
 
369 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  28.86 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  32.31 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  36.49 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  32.14 
 
 
723 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  28.83 
 
 
442 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  30.15 
 
 
451 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  30.39 
 
 
417 aa  90.1  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  29.74 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  28.84 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  29.48 
 
 
425 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  27.53 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  30.15 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  33.95 
 
 
703 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.798667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>