32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3213 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  100 
 
 
471 aa  883    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  89.6 
 
 
471 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  57.57 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  48.07 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  44.85 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  46.11 
 
 
442 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  39.14 
 
 
442 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  34.99 
 
 
462 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  34.57 
 
 
501 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  37.93 
 
 
433 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  36.65 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  35.18 
 
 
400 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  34.93 
 
 
435 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  34.44 
 
 
377 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  35.58 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  30.3 
 
 
418 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  31.49 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  31.12 
 
 
442 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  32.04 
 
 
723 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  35.96 
 
 
448 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  30.95 
 
 
451 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  30.17 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  30 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  28.42 
 
 
445 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  30.93 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  30.79 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  28.34 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  29.74 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  29.74 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  29.46 
 
 
412 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  35.8 
 
 
703 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.798667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  38.37 
 
 
369 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>