31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  856    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  32.58 
 
 
435 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  36.45 
 
 
442 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  32.81 
 
 
400 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  32.38 
 
 
442 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  33.42 
 
 
417 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  29.38 
 
 
418 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  31.05 
 
 
471 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  32.18 
 
 
443 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  33.51 
 
 
442 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  35.28 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  33.64 
 
 
442 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  28.84 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  31.73 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  33.51 
 
 
433 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  31.86 
 
 
454 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  28.69 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  30.62 
 
 
501 aa  80.1  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  30.64 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  28.65 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  28.25 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  32.4 
 
 
369 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  30.15 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  32.14 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  31.85 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  31.72 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  31.72 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  32.59 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  29.47 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  28.48 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  31.44 
 
 
723 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>