34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6199 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  48.77 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  40.16 
 
 		 417 aa  200  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  41.11 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  38.24 
 
 		 498 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  32.49 
 
 		 462 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  37.92 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  33.67 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  36.29 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  35.68 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  32.09 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  36.29 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  34.9 
 
 		 471 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  33.87 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  35.69 
 
 		 377 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  31.78 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  35.79 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  37.5 
 
 		 723 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  34.27 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  34.66 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  32.97 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  34.18 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  32.58 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  33.44 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  34.29 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  35.87 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  31.52 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  35.35 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  32.5 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  40.59 
 
 		 703 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.798667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2884  acyltransferase 3  31.73 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773243  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  30.92 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>