34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1827 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  100 
 
 		 442 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  46.3 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  45.41 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  47.49 
 
 		 498 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  44.59 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  39.42 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  44.92 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  42.02 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  39.24 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  37.56 
 
 		 433 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  35.71 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  35.44 
 
 		 377 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  36.78 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  37.62 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  33.42 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  33.25 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  37.46 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  32.43 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  31.56 
 
 		 474 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  30.49 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  34.09 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  31.93 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  32.51 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  33.15 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  32.18 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  32.18 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  31.6 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  34.33 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  33.24 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  31.17 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  31.71 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2884  acyltransferase 3  29.91 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773243  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  35.96 
 
 		 703 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.798667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  29.91 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>