34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  43.15 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  41.62 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  37.22 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  33.52 
 
 		 501 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  32.88 
 
 		 498 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  36.27 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  28.53 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  33.05 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  33.88 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  34.67 
 
 		 400 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  32.65 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  30.99 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 471 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  29.44 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  36.54 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  32.34 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  33.54 
 
 		 723 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  32.02 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  31.86 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  31.6 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  31.6 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  33.44 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  34.43 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  31.67 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  33.12 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  29.95 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  27.19 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2884  acyltransferase 3  27.19 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773243  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  28.74 
 
 		 703 aa  42.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.798667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>