33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4601 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  841    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  48.53 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  35.75 
 
 		 443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  35.28 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  35.83 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  34.49 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  32.11 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  33.43 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  33.43 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  37.12 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  36.36 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  32.41 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  37.62 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  33.66 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  32.87 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  31.42 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  35.8 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  34.94 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  31.74 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  36.09 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  33.02 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  31.23 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  35.75 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  31.07 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  32.16 
 
 		 425 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  31.61 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  31.61 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  32.17 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  29.91 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2884  acyltransferase 3  28.11 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773243  normal  0.664883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>